Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3CQ99985 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms