Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF6Q99612 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF6Q99612 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms