Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms