Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms