Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms