Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms