Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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