Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms