Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms