Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP3Q96P20 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms