Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD27Q96NW4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms