Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD6Q96NK8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms