Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC17Q96LX7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms