Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf72Q96LT7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf72Q96LT7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms