Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX27Q96L92 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms