Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF479Q96JC4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF479Q96JC4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms