Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms