Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35A4Q96G79 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms