Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SGF29Q96ES7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SGF29Q96ES7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGF29Q96ES7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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