Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms