Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKL1Q969V6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms