Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms