Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C6Q969F1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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