Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX38Q92620 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms