Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms