Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC4Q8TBB5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms