Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf62Q8N4C0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf62Q8N4C0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms