Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPC2Q8N158 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC2Q8N158 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms