Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTROBQ8N137 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms