Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms