Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms