Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF1Q7Z6J0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF1Q7Z6J0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF1Q7Z6J0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF1Q7Z6J0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms