Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SV2AQ7L0J3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms