Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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