Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBR3Q6ZT12 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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