Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF493Q6ZR52 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms