Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA5Q6Q788 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms