Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms