Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms