Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms