Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms