Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms