Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms