Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms