Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPRD2Q5VT52 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms