Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH4AQ5TD94 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms