Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFHC1Q5JVL4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms