Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCID2Q5JVF3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms