Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN4Q5BKX8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms