Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSP90AB4PQ58FF6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSP90AB4PQ58FF6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSP90AB4PQ58FF6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSP90AB4PQ58FF6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSP90AB4PQ58FF6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSP90AB4PQ58FF6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB4PQ58FF6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms